ไอโซโทปที่สำคัญที่สุดของมันคือพลูโทเนียม -239 ซึ่งผลิตขึ้นในปริมาณมากในเครื่องปฏิกรณ์นิวเคลียร์จากยูเรเนียมธรรมชาติ -238 ซึ่งช่วยให้สามารถใช้ประโยชน์จากยูเรเนียมได้อย่างสมบูรณ์ พลูโทเนียมมีความสำคัญในฐานะแหล่งพลังงานสำหรับดาวเทียมและสถานีอวกาศ